北京中心於 1998 年由美籍耶穌會士安東神父 (Fr. Ron Anton) 成立，其目的是希望該中心能成為耶穌會高等教育國際網絡在中國的樞紐，為廣大的社群及耶穌會中華省的智力使徒工作服務。該中心圖書館的藏書從成立初期僅有 70 本書，在十年間增加到一萬七千冊，而到今日有逾兩萬七千冊，開放全球線上搜尋。