耶稣会的萌芽始于会祖圣依纳爵．罗耀拉在巴黎大学读书时的伙伴关系与友谊。

1491年：
耶稣会祖圣依纳爵．罗耀拉出生在西班牙北部巴斯克山区，他是一个贵族家庭的么儿，成年后怀着一份成为勇猛武士的梦想与骄傲服役于王室的军队。

依纳爵30岁的那年，他在一场战役中右腿受伤，之后回到家乡开始了一段长期的疗养。在那段时间他手边只有几本宗教方面的书，这些书籍和长期疗养的与世隔绝，孕育了创立耶稣会的种子。依纳爵开始祈祷、斋戒、忏悔以及做爱德工作，决心献身于上主。

1534年：
依纳爵跟他的六个伙伴，七人一起在巴黎附近蒙玛特山的教堂里，一起承诺在学业结束后继续他们的伙伴关系。他们愿意按福音精神守神贫，并且继续一个前往耶路撒冷的使命。他们称自己为‘在主内的朋友’。

1540年：
耶稣会被教宗保禄三世正式批准成立，依纳爵被选为总会长，并在这个职务上服务，直到1556年，他65岁辞世为止。

依纳爵出生的年代，长达八百年的中世纪刚刚结束，欧洲掀起了文艺复兴的浪潮，依纳爵生于两个世代交替的交会点上。当
时，欧洲的探险队已经发现了美洲与非洲，学者重新发现被遗忘几世纪的希腊罗马文化。很巧合的，在依纳爵受伤的那年，马丁路德因为宗教改革的思想被开除教籍，往后的二十年，在英国、荷兰、瑞士及北欧，天主教会失去了相当多的掌控权，也造成教会内许多分歧的思想。社会中兴起了前所未有的中产阶级，而印刷术的发明恰好满足了他们对知识的渴望。

中古的骑士时代结束，新的人文主义兴起，社会动乱战争频仍，那是一个翻天覆地的时代。

1540年耶稣会被教宗保禄三世正式批准成立，依纳爵被选为总会长，并在这个职务上服务，直到1556年，他65岁辞世。