北京中心于 1998 年由美籍耶稣会士安东神父 (Fr. Ron Anton) 成立，其目的是希望该中心能成为耶稣会高等教育国际网络在中国的枢纽，为广大的社群及耶稣会中华省的智力使徒工作服务。该中心图书馆的藏书从成立初期仅有 70 本书，在十年间增加到一万七千册，而到今日有逾两万七千册，开放全球线上搜寻。